2021年4月27日,上海交通大学生命科学技术学院、微生物代谢国家重点实验室冯雁团队Nucleic Acids Research(最新影响因子:11.501)在线发表学术论文“Argonaute integrated single-tube PCR system enables supersensitive detection of rare mutations”。

  上海交通大学副研究员刘倩和博士生郭翔为该论文共同第一作者,冯雁教授为通讯作者。研究工作由上海交通大学、上海交通大学附属第一医院、仁济医院、人和未来生物科技公司等合作完成。上海交通大学转化医学中心提供研究平台支持。

文章简介

  针对血液或体液中肿瘤细胞释放DNA片段的液体活检技术,凭借其无创性、敏感性、动态性等特质,可实现肿瘤早期筛查及伴随诊断。然而,由于游离核酸含量低和易降解,因此在复杂背景基因中来特异性富集和检测肿瘤基因得到广泛关注。常用的PCR等方法具有简单、省时等优点,但其检测灵敏度有限;近年来,基因编辑工具酶CRISPR/Cas在核酸检测中的应用,提升了检测灵敏度和便捷性,但Cas酶对靶标序列PAM选择性、长链guide RNA合成昂贵且不稳定等问题,导致检测成本、灵敏度、多重性等方面仍存在局限性。因此,研发能特异性富集靶标序列的新型核酸酶是解决上述难题的有效途径,建立高灵敏度、多重和简便的新型核酸检测技术对于基础研究和临床应用都具有重要意义。

  该工作揭示了不同高温微生物 Argonaute蛋白的核酸酶特性,发现其对单碱基突变(SNV)靶标序列精准识别的规律,发展了“一管式”PCR多重核酸富集和检测的A-Star(Ago-Directed Specific Target Enrichment and Detection)新策略,实现血液等样本中低丰度突变基因的高效、多重富集和检测

  文章链接:https://doi.org/10.1093/nar/gkab274

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